Pseudomonas Putida - Ringkasan
- Pseudomonas putida adalah bakteri berbentuk batang berflagel Gram-negatif yang umumnya diisolasi dari sampel lingkungan dan klinis yang beragam.
- Organisme ini sering menjadi penghuni habitat rizosfer dan air tawar dan memiliki keserbagunaan metabolisme yang beragam terhadap berbagai senyawa biogenik dan xenobiotik.
- P. putida adalah penyebab infeksi yang jarang pada berbagai bagian tubuh, terutama pada individu dengan gangguan kekebalan seperti bayi baru lahir dan pasien kanker. P. putida adalah bagian dari kelompok fluoresen spesies Pseudomonas karena mereka menghasilkan berbagai bentuk pigmen fluoresen. Karakteristik terpenting yang membedakan P. putida dari P. aeruginosa adalah ketidakmampuan P. putida untuk menghidrolisis gelatin.
- Selain itu, fitur lain seperti ketidakmampuan untuk menghasilkan pigmen fenazin, untuk denitrifikasi, dan tumbuh pada 41°C juga membantu dalam diferensiasi P. putida dari spesies P. fluorescens dan P. aeruginosa.
- Nama genus 'putida' berasal dari istilah Latin 'putida', yang berarti bau atau busuk, menunjukkan adanya bakteri pada makanan yang rusak dan bau aromatik pada media padat. Spesies ini ditemukan oleh Trevisan pada tahun 1889. Pseudomonas putida dianggap sebagai kelompok evolusioner yang mencakup spesies lain seperti P. fulva, P. parafulva, P. alkylphenolia dan P. monteilii.
- Seperti kebanyakan spesies Pseudomonas, P. putida juga menunjukkan beberapa bentuk resistensi antibiotik terhadap antibiotik tertentu sebagai akibat dari adanya plasmid yang membawa gen yang mengkode resistensi antibiotik. Kehadiran plasmid tersebut juga meningkatkan kemungkinan transfer plasmid ke mikroorganisme lain di lingkungan rumah sakit.
- P. putida merupakan mikroorganisme pertama yang dipatenkan di dunia karena kemampuannya menguraikan hidrokarbon. Metabolisme organisme yang beragam telah dimanfaatkan untuk digunakan dalam bioremediasi dan industri. Demikian pula, kemampuan untuk menghasilkan metabolit sekunder juga memungkinkan penggunaan P. putida sebagai agen biokontrol untuk melindungi terhadap mikroorganisme patogen.
Klasifikasi Pseudomonas putida
- Klasifikasi bakteri ke dalam ordo, famili, dan genus yang berbeda sangat penting dalam bidang mikrobiologi dan epidemiologi lingkungan.
- Secara tradisional, klasifikasi dibuat berdasarkan karakteristik fenotipik dan metabolisme organisme seperti morfologi, karakteristik kultur, dan pengujian biokimia.
- Baru-baru ini, dasar klasifikasi telah diubah menjadi analisis komponen asam nukleat.
- Dasar yang paling umum untuk klasifikasi bakteri termasuk urutan DNA melalui metode seperti analisis fragmen DNA dan analisis urutan DNA.
- Pada tingkat genus dan spesies, bagaimanapun, analisis urutan gen 16S rRNA diadopsi.
- Pseudomonas putida dianggap sebagai kelompok evolusioner dan mencakup beberapa spesies lain berdasarkan urutan 16S rRNA yang umum.
- P. putida diklasifikasikan lebih lanjut menjadi dua biovar; biovar A dan biovar B. ada sekitar 103 strain dalam biovar A dan sekitar sembilan strain milik biovar B.
Berikut
klasifikasi taksonomi P. putida:
Domain Bacteria
Phylum Proteobacteria
Class Gammaproteobacteria
Order Pseudomonadales
Family Pseudomonadaceae
Genus Pseudomonas
Species P. putida
Habitat Pseudomonas putida
- Pseudomonas putida adalah saprofit yang dapat ditemukan di berbagai habitat ekologi seperti tanah (kebanyakan rizosfer), saluran air, air tawar dan air asin, dan permukaan bernyawa tanaman, hewan, dan manusia.
- Kemampuan suatu organisme untuk bertahan hidup di habitat yang berbeda bergantung pada musim dan mekanisme adaptif yang diadopsi oleh organisme tersebut.
- Organisme ini memiliki relung yang sangat luas sebagai hasil dari kemampuan metabolisme dan kompetitif mereka.
- Mereka dapat menggunakan berbagai senyawa metabolik dan dapat menahan berbagai tantangan abiotik.
- Meskipun P. putida dan P. fluorescens cenderung ada di habitat yang sama, keberadaan P. putida lebih banyak di rumah tangga yang disebabkan oleh keberadaan P. putida di limbah dan air limbah.
- P. putida tidak diisolasi dari sebagian besar lokasi bersuhu tinggi yang dapat menampung P. fluorescens dan P. aeruginosa karena ketidakmampuan P. putida untuk bertahan hidup pada suhu yang lebih tinggi seperti 42°C.
- Kebanyakan strain P. putida memiliki distribusi global yang luas dengan beberapa spesies diisolasi dari sampel tanah di dalam dan sekitar danau di Antartika.
- Namun, ada beberapa strain yang memiliki distribusi yang lebih terbatas sebagai akibat dari metabolisme yang kurang fleksibel.
- Pada hewan dan manusia, P. putida terjadi sebagai spesies non-patogen, tetapi beberapa strain dapat bertindak sebagai patogen oportunistik pada individu dengan gangguan sistem imun dan bayi baru lahir.
- P. putida adalah aerob obligat dan dengan demikian, membutuhkan lingkungan yang kaya oksigen untuk pertumbuhan dan perkembangan.
- Beberapa anggota kelompok P. putida termasuk penghuni normal bagian tumbuhan seperti akar dan daun.
Morfologi Pseudomonas putida
- Sel P. putida merupakan sel berbentuk batang Gram negatif dengan ukuran panjang 0,5-1,0 µm.
- Panjang sel mungkin berbeda tergantung pada usia sel pada media kultur karena sel muda cenderung lebih panjang.
- Beberapa sel organisme mungkin memiliki rasio lebar terhadap panjang yang bervariasi tergantung pada kondisi kultur. Beberapa sel lebih panjang dan lebih luas dan mungkin terlihat berserabut.
- Sebagian besar sel terjadi sebagai sel tunggal, tetapi beberapa pasangan mungkin diamati secara ujung-ke-depan.
- Permukaan luar sel terdiri dari flagela karena P. putida adalah bakteri motil. Jumlah flagela dapat berupa satu atau lebih.
- Selain flagela, sel-sel juga terdiri dari fimbriae atau pili di permukaan luar, yang membantu pergerakan serta perlekatan.
- Selubung sel membentuk penutup terluar dari bakteri, yang terdiri dari tiga lapisan yang berbeda; membran luar, lapisan peptidoglikan, dan membran sel.
- Lapisan peptidoglikan bertanggung jawab untuk melindungi bakteri terhadap mikroba lain dan agen antibakteri.
- Membran sel terdiri dari lapisan ganda lipid, yang dilengkapi untuk mengubah fluiditas membran sesuai dengan kondisi lingkungan luar.
- Jumlah protein dalam P. putida berkisar antara 3748-6780, sedangkan kandungan GC genom sekitar 60%.
- Pseudomonas putida termasuk dalam kelompok fluoresen spesies Pseudomonas dan menghasilkan pigmen pyoverdine berpigmen fluoresen. Namun, mereka tidak menghasilkan pigmen fenazin.
Karakteristik
Kultur Pseudomonas putida
- Pseudomonas putida yang diisolasi dari sampel lingkungan cukup mudah tumbuh pada media kultur buatan karena memiliki kebutuhan nutrisi yang minimal.
- Suhu pertumbuhan P. putida berkisar antara 15-35°C, dan suhu optimum untuk pertumbuhan antara 30-35°C.
- P. putida dapat dibedakan dari Pseudomonas fluoresen lainnya berdasarkan ketidakmampuan organisme untuk bertahan hidup pada suhu 41°C.
- Demikian pula pH optimum untuk pertumbuhan terletak antara nilai pH 7-8. Bakteri berkembang biak dengan adanya oksigen.
- Tergantung pada sampel, lima jenis koloni P. putida yang berbeda dapat dilihat pada media kultur buatan.
- Isolat lingkungan berbentuk lingkaran dan halus yang cembung, dan berbentuk kubah dengan permukaan yang mengkilat.
- Isolat klinis cenderung menghasilkan koloni mukoid dengan seluruh tepi yang tampak buram, homogen, keputihan, atau berwarna hijau keabu-abuan.
- Koloni Pseudomonas berfluoresen seperti P. putida biasanya membentuk koloni jenis penyebar keriput dan penyebar kabur pada media buatan.
Berikut
ini adalah beberapa ciri kultur P. putida pada media kultur yang berbeda:
1.
Pseudomonas putida dalam Nutrient Agar
- Koloni putih halus dengan seluruh tepi dan bentuk cembung diamati pada NA.
- Koloni yang lebih muda tampak melingkar, dan mereka mungkin menjadi lebih luas setelah inkubasi lebih lama. Selain itu, koloninya berbutir, berkilau, hampir buram, dan hijau pucat dengan pusat gelap.
- Di bawah sinar matahari atau radiasi UV, koloni menghasilkan warna kehijauan yang dapat larut dalam media.
- Sampel lingkungan P. putida dari tanah dan air biasanya diisolasi pada NA.
2.
Pseudomonas putida dalam Cetrimide Agar
- Pertumbuhan bakteri pada agar Cetrimide diambil sebagai uji identifikasi spesies Pseudomonas karena agar selektif untuk spesies Pseudomonas.
- Koloni pada agar cetrimide tampak kering dan rata dengan lingkar melingkar dan tepi lobular.
- Pada agar cetrimide, koloni opak dan kehijauan terlihat sebagai hasil difusi pigmen ke media kultur.
- Pertumbuhan P. putida pada agar Cetrimide sering dilakukan sebagai bentuk identifikasi organisme.
3.
Pseudomonas putida di MacConkey Agar
- Pada agar MacConkey, koloni P. putida tampak bulat dan rata. Warna media tetap tidak berubah karena organisme adalah non-fermentor laktosa.
- Organisme ini, bagaimanapun, menghasilkan pigmen yang berdifusi melalui media, menghasilkan warna kehijauan di sekitar koloni.
Karakteristik Biokimia Pseudomonas putida
Karakteristik
biokimia P. putida dapat ditabulasikan sebagai berikut:
S.N |
Biochemical Characteristics |
Pseudomonas putida |
1. |
Capsule |
Non-Capsulated |
2. |
Shape |
Rod |
3. |
Gram Staining |
Gram-Negative |
4. |
Catalase |
Positive (+) |
5. |
Oxidase |
Positive (+) |
6. |
Citrate |
Negative (-) |
7. |
Methyl Red (MR) |
Negative (-) |
8. |
Voges Proskauer (VR) |
Negative (-) |
9. |
OF (Oxidative-Fermentative) |
Oxidative |
10. |
Coagulase |
Negative (-) |
11. |
DNase |
Negative (-) |
12. |
Urease |
Negative (-) |
13. |
Gas |
Negative (-) |
14. |
H2S |
Negative (-) |
15. |
Hemolysis |
β-hemolytic |
16. |
Motility |
Motile with multiple flagella |
17. |
Nitrate Reduction |
Negative (-) |
18. |
Gelatin Hydrolysis |
Negative (-) |
19. |
Starch Hydrolysis |
Negative (-) |
20. |
Casein Hydrolysis |
Negative (-) |
21. |
Pigment Production |
Positive (+) (Yellow-green) |
22. |
Indole |
Negative (-) |
23. |
TSIA (Triple Sugar Iron Agar) |
Alkali/Alkali (Red/ Red) |
24. |
Spore |
Non-sporing |
25. |
Cetrimide Test |
Positive (+) |
26. |
Denitrification |
Negative (-) |
Fermentasi
S.N |
Substrate |
Pseudomonas putida |
1. |
Adonitol |
Negative (-) |
2. |
Arabinose |
Negative (-) |
3. |
Cellobiose |
Negative (-) |
4. |
Dulcitol |
Negative (-) |
5. |
Fructose |
Positive (+) |
6. |
Galactose |
Positive (+) |
7. |
Glucose |
Positive (+) |
8. |
Glycerol |
Positive (+) |
9. |
Glycogen |
Negative (-) |
10. |
Hippurate |
Positive (+) |
11. |
Inulin |
Negative (-) |
12. |
Inositol |
Negative (-) |
13. |
Lactose |
Negative (-) |
14. |
Malonate |
Positive (+) |
15. |
Maltose |
Negative (-) |
16. |
Mannitol |
Positive (+) |
17. |
Mannose |
Positive (+) |
18. |
Pyruvate |
Negative (-) |
19. |
Raffinose |
Negative (-) |
20. |
Rhamnose |
Negative (-) |
21. |
Ribose |
Positive (+) |
22. |
Salicin |
Negative (-) |
23. |
Sorbitol |
Negative (-) |
24. |
Starch |
Negative (-) |
25. |
Sucrose |
Negative (-) |
26. |
Trehalose |
Negative (-) |
27 |
Xylose |
Positive (+) |
Reaksi Enzimatik
S.N |
Enzymes |
Pseudomonas putida |
1. |
Acetoin |
Negative (-) |
2. |
Acetate Utilization |
Positive (+) |
3. |
Arginine Dehydrolase |
Positive (+) |
4. |
Esculin Hydrolysis |
Negative (-) |
5. |
Lecithinase |
Negative (-) |
6. |
Lipase |
Positive (+) |
7. |
Lysine Decarboxylase |
Negative (-) |
8. |
Ornithine Decarboxylase |
Negative (-) |
9. |
Phenylalanine Deaminase |
Negative (-) |
Faktor Virulensi Pseudomonas putida
- Pseudomonas putida adalah bakteri non-patogen yang ditemukan di sumber lingkungan seperti udara, air, dan tanah.
- Organisme ini mengkolonisasi bagian tubuh hewan yang berbeda sebagai bakteri asli, tetapi jarang dapat menyebabkan infeksi nosokomial pada individu dengan gangguan sistem imun.
- Atribut yang paling penting adalah kemampuan P. putida menyebabkan infeksi adalah kemampuannya untuk bertahan hidup pada suhu 37°C.
- Itu juga dapat menahan suhu rendah 4 ° C dan dengan demikian dapat bertahan dalam darah dan sampel klinis lainnya yang disimpan untuk digunakan lebih lanjut.
- Terdapat berbagai atribut dan struktur yang mendukung mekanisme produksi penyakit oleh P. putida.
- P. putida tidak virulen seperti spesies Pseudomonas fluoresen lainnya seperti P. aeruginosa dan P. fluorescens, tetapi, bagaimanapun, memiliki beberapa faktor umum seperti resistensi antibiotik.
- Mekanisme pasti penyakit atau patogenesis P. putida belum dipahami, tetapi diketahui bahwa resistensi antibiotik dan pembentukan biofilm berperan penting dalam proses tersebut.
Beberapa
faktor virulensi umum yang terkait dengan infeksi yang disebabkan oleh P.
putida dapat dijelaskan sebagai berikut:
1.
Flagela dan pili
- Flagela dan pili merupakan komponen struktural P. putida yang terlibat dalam perlekatan dan pergerakan bakteri melalui jaringan.
- P. putida memiliki lebih dari satu flagela yang memungkinkan pergerakan bakteri melalui gerakan berenang.
- Flagela digerakkan oleh motor yang ada di dasar yang menggerakkan filamen secara heliks.
- Demikian pula, pili yang ada di permukaan luar bakteri membantu mengikat bakteri ke permukaan sel host.
- Kedua struktur ini sangat penting dalam pergerakan dan kolonisasi permukaan jaringan host oleh P. putida.
- Selain membantu dalam kolonisasi, flagela dan pili juga penting dalam pembentukan biofilm dengan memungkinkan pengikatan beberapa sel satu sama lain.
2.
Penginderaan Kuorum dan Biofilm
- Quorum sensing merupakan mekanisme penting pengaturan berbagai sel populasi Pseudomonas untuk membantu proses perkembangan penyakit.
- Penginderaan kuorum bertanggung jawab untuk produksi alginat yang memfasilitasi akumulasi bahan ekstraseluler dan sel untuk membentuk biofilm pada permukaan hidup dan mati.
- Salah satu faktor predisposisi pembentukan biofilm adalah adanya alat kesehatan seperti kateter dan respirator.
- Pembentukan biofilm membantu dalam perlindungan bakteri terhadap sistem kekebalan host serta komponen antibiotik.
3.
Metabolit sekunder
- Pseudomonas putida adalah salah satu dari sedikit spesies fluoresen Pseudomonas yang mampu menghasilkan metabolit sekunder dengan sifat antibakteri.
- Produk ini termasuk senyawa seperti hidrogen sianida dan rhizoxin, yang membantu bakteri bersaing dengan agen mikroba lainnya.
- Hidrogen sianida sangat penting untuk melawan patogen tanaman karena mengganggu asupan air dan mineral oleh mikroorganisme yang bersaing.
- Dalam kasus sel mamalia, produksi hidrogen sianida oleh P. putida diatur oleh gen hcnABC yang diregulasi tanpa adanya oksigen.
4.
Lipopolisakarida
- Selubung luar P. putida terdiri dari lipopolisakarida yang melindungi bakteri dari fagositosis dan lisis.
- Selain itu, lipid A yang ada pada membran juga menginduksi aktivitas sitotoksik dan selanjutnya membantu perlindungan terhadap fagositosis.
- Lipopolisakarida juga menyebabkan stimulasi berlebihan pada sistem kekebalan tubuh, menghasilkan pelepasan faktor-faktor seperti IL-8 dan TNF-α.
- Telah ditemukan bahwa respon inflamasi yang berlebihan adalah penyebab utama dari produksi penyakit di berbagai organ.
5.
Protease
- Produksi protease seperti elastase dan fosfolipase juga terlibat dalam kerusakan jaringan dan memfasilitasi penyebaran bakteri ke area yang berbeda.
- Fosfolipase terlibat dalam degradasi fosfolipid yang membentuk konstituen penting dari komponen lipid tubuh.
- Salah satu produk degradasi fosfolipid adalah diasilgliserol yang memiliki aktivitas toksigenik terhadap sel host dengan menginduksi produksi metabolit seperti protein kinase dan asam arakidonat.
- Metabolit ini selanjutnya menginduksi respon inflamasi dan menyebabkan kerusakan jaringan.
Patogenesis Pseudomonas putida
- Karena sebagian besar galur P. putida tidak terkait dengan penyakit dan merupakan saprofit yang ditemukan di lingkungan alami, banyak yang tidak diketahui tentang patogenesis penyakit yang disebabkan oleh P. putida.
- Diketahui bahwa infeksi terjadi pada individu dengan gangguan sistem imun sebagai akibat dari respon inflamasi yang diinduksi.
- Situs umum infeksi termasuk paru-paru dan aliran darah, yang jika disebarluaskan dapat menyebabkan penyakit parah.
- Terjadinya infeksi P. putida lebih sering terjadi pada pasien dengan cystic fibrosis dan AIDS karena respon imun pada pasien tersebut lambat atau berkurang.
- Masuknya P. putida ke dalam tubuh manusia dapat terjadi baik melalui transfusi darah yang terkontaminasi atau sebagai akibat dari perpindahan bakteri ke tempat-tempat steril di tubuh.
- Keseluruhan proses patogenesis P. putida difasilitasi oleh berbagai faktor virulensi yang membantu masuk, kolonisasi, kerusakan jaringan, dan resistensi antibiotik.
Proses
patogenesis infeksi yang disebabkan oleh P. putida dapat dijelaskan di bawah
ini:
1.
Masuk dan Kolonisasi
- Masuknya bakteri ke dalam tubuh host dapat terjadi baik karena transfusi darah yang terkontaminasi di rumah sakit atau karena masuknya bakteri ke tempat steril tubuh melalui luka atau luka bakar.
- Flagela dan pili adalah dua struktur penting yang memfasilitasi masuknya bakteri ke dalam jaringan host. Flagela memungkinkan pergerakan bakteri sementara pili memfasilitasi perlekatan bakteri ke situs target.
- Selama kolonisasi, bakteri lolos dari fagositosis karena lapisan lipopolisakarida bakteri melindungi terhadap aktivitas makrofag.
- Setelah menempel pada permukaan sel host, bakteri mulai mengambil mineral dan nutrisi dari sel host untuk bertahan hidup dan bereproduksi.
2.
Kerusakan jaringan
- Langkah kedua dalam patogenesis infeksi P. putida adalah kerusakan jaringan dan penyebaran bakteri ke berbagai bagian tubuh.
- Ini difasilitasi oleh produksi berbagai protein seperti enzim dan racun yang membantu menurunkan sel host.
- Beberapa enzim umum yang terlibat dalam proses termasuk protease seperti elastase yang mendegradasi protein elastin dan juga memungkinkan penyebaran bakteri ke sel tetangga.
- Fosfolipase, di sisi lain, mendegradasi fosfolipid yang ada pada membran sel sel host dan menyebabkan pelepasan komponen sitoplasma, yang akhirnya menyebabkan nekrosis.
- Produk dari degradasi ini dapat menginduksi respon inflamasi oleh sistem imun host, yang menyebabkan kerusakan jaringan lebih lanjut.
3.
Pembentukan biofilm
- Pembentukan biofilm adalah metode perlindungan terhadap respon imun host serta terhadap agen antimikroba.
- Pembentukan biofilm pada P. putida dipengaruhi oleh senyawa alginat dan matriks ekstraseluler yang dihasilkan oleh bakteri.
- Biofilm menyediakan lingkungan pelindung yang membantu dalam retensi kelembaban dan ketersediaan nutrisi untuk semua sel bakteri.
- Selain produk metabolisme yang terlibat dalam pembentukan biofilm, komponen struktural seperti pili juga memainkan peran penting.
Manifestasi Klinis Pseudomonas putida
- Infeksi yang disebabkan oleh P. putida spesifik pada bagian tubuh tertentu di mana bakteri berkoloni dan berkembang biak.
- Beberapa tempat umum infeksi yang disebabkan oleh P. putida termasuk aliran darah, jaringan lunak, dan paru-paru.
- Sebagian besar infeksi ini ringan; Namun, mereka mungkin menjadi parah jika pasien memiliki beberapa kondisi yang mendasarinya.
- Kondisi yang mendasarinya dapat berupa defek mukokutan atau gangguan kekebalan yang mendasarinya.
- Infeksi dapat mengakibatkan kegagalan multiorgan yang diinduksi sepsis fulminan, yang menyebabkan kematian.
Beberapa
manifestasi klinis umum dari infeksi yang disebabkan oleh P. putida meliputi:
1.
Bakteremia
- Bakteremia adalah manifestasi paling mengerikan dan umum dari P. putida, di mana bakteri mencapai aliran darah pasien.
- Demam berkala dan menggigil diamati sebagai satu set bakteri baru dilepaskan ke dalam aliran darah setelah reproduksi.
- Infeksi ini dapat terjadi setelah infeksi jaringan lunak karena bakteri masuk ke aliran darah atau karena transfusi darah yang terkontaminasi.
- Ada kasus bakteremia yang berkembang lebih lanjut menjadi kegagalan multiorgan yang diinduksi sepsis fulminan.
- Tingkat keparahan infeksi lebih sering terjadi pada pasien dengan beberapa kondisi yang mendasarinya.
- Faktor-faktor lain seperti usia lanjut dan kekurangan gizi adalah kemungkinan penyebab penurunan respon imun meskipun pengobatan agresif.
2.
Infeksi jaringan lunak
- Infeksi kulit dan jaringan lunak yang disebabkan oleh P. putida jarang terjadi dan biasanya hanya ditemukan pada individu dengan gangguan sistem imun.
- Situs umum infeksi termasuk tulang rawan dan jaringan ikat. Infeksi dapat dideteksi melalui gejala seperti pembentukan lesi ulseratif di situs target.
- Masuknya bakteri diasumsikan melalui trauma pada permukaan kulit yang memungkinkan bakteri untuk mencapai situs target.
- Sebagian besar pasien cenderung memiliki beberapa kondisi mendasar, seperti infeksi HIV dan insufisiensi ginjal.
- Dengan tidak adanya cakupan antimikroba yang tepat, kondisi pasien dapat memburuk, yang dapat menyebabkan bakteremia dan kematian.
3.
Infeksi saluran pernafasan
- Contoh infeksi saluran pernapasan yang didapat di rumah sakit juga merupakan hasil yang mungkin dari infeksi P. putida.
- Sumber bakteri diasumsikan dari bronkoskop yang terkontaminasi yang menularkan infeksi dari satu pasien ke pasien lain di rumah sakit.
- Isolasi bakteri dari sampel seperti aspirasi trakea dan dahak dapat digunakan sebagai metode diagnosis infeksi P. putida karena dapat dikacaukan dengan infeksi lain.
Diagnosis Lab Pseudomonas putida
- Diagnosis laboratorium infeksi bakteri sering dikaitkan dengan isolasi dan identifikasi bakteri dari tempat infeksi.
- Proses diagnosis juga tergantung pada jenis sampel yang digunakan. Dalam kasus darah, kultur dilakukan untuk mengisolasi bakteri.
- Tahap awal identifikasi didasarkan pada isolasi dan identifikasi bakteri berdasarkan ciri morfologi dan biokimianya.
- Metode lain yang lebih canggih, termasuk metode imunologi dan molekuler, memberikan identifikasi dan diagnosis yang lebih akurat.
- Diagnosis dini infeksi yang disebabkan oleh P. putida sangat penting untuk pengobatan dini karena perkembangan penyakit dapat menyebabkan komplikasi.
Berikut
ini adalah metode rinci diagnosis laboratorium P. putida dari sampel klinis:
1.
Identifikasi awal
- Metode identifikasi awal P. putida melibatkan isolasi bakteri dari sampel klinis.
- Isolasi dicapai dengan pertumbuhan bakteri pada media pertumbuhan buatan. Morfologi koloni yang dihasilkan oleh bakteri memberikan beberapa informasi tentang identifikasi bakteri.
- Ini diikuti oleh pengamatan mikroskopis organisme untuk mengamati morfologinya. Untuk mengkonfirmasi keberadaan P. putida dalam sampel klinis, tes biokimia khusus untuk P. putida dilakukan.
- Uji hidrolisis gelatin dan kemampuan tumbuh pada suhu 41°C merupakan dua uji biokimia yang penting untuk membedakan P. putida dari spesies Pseudomonas lainnya.
2.
Metode imunologis
- Immunoassays didasarkan pada identifikasi protein dan enzim yang spesifik untuk bakteri melalui teknik seperti ELISA dan Western Blotting.
- Selain itu, rapid tes lainnya juga dapat dilakukan untuk mengidentifikasi bakteri berdasarkan ada tidaknya antigen dan struktur serupa lainnya.
3.
Metode molekuler
- Metode molekuler diagnosis penyakit adalah teknik baru yang terus diterapkan dalam pengobatan modern untuk hasil yang lebih andal dan akurat.
- Metode seperti PCR dan sekuensing DNA secara perlahan menggantikan metode diagnosis awal karena lebih memakan waktu.
- Metode molekuler mendeteksi protein tertentu, segmen DNA, atau fragmen rRNA yang spesifik untuk bakteri tertentu.
Pengobatan Pseudomonas putida
- Ceftazidime adalah obat pilihan untuk P. putida bersama dengan imipenem dan meropenem.
- Selain itu, obat antibakteri lain seperti karbapenem, aminoglikosida, tetrasiklin, dan polimiksin B juga dapat digunakan sebagai kemungkinan pengobatan terhadap P. putida.
- Resistensi antibiotik merupakan masalah dalam pengobatan P. putida karena bakteri ditemukan resisten terhadap karbenisilin dan gentamisin, yang digunakan untuk pengobatan P. aeruginosa.
- Dalam kasus infeksi terkait perangkat, penghapusan perangkat tersebut diperlukan. Tergantung pada tingkat keparahan penyakit, masuk ICU mungkin diperlukan.
- Pengujian kerentanan antibiotik harus dilakukan untuk menentukan kerentanan bakteri terhadap antibiotik yang berbeda.
Pencegahan
Pseudomonas putida
- Penularan P. putida terjadi di lingkungan rumah sakit yang menunjukkan bahwa pencegahan penyakit dapat dicapai dengan mengikuti pedoman yang tepat di lingkungan rumah sakit.
- Kebanyakan bakteri ditularkan melalui petugas rumah sakit selama transfusi darah, sehingga melakukan tes darah sebelum transfusi darah sangat penting untuk mencegah infeksi tersebut.
- Petugas kesehatan harus menggunakan sarung tangan dan mantel untuk mencegah perpindahan bakteri di dalam pasien atau ke mereka.
- Penggunaan makanan atau bunga yang terkontaminasi harus dihindari karena barang-barang tersebut dapat bertindak sebagai kendaraan bagi bakteri.
- Karena infeksi dimulai dengan infeksi topikal pada kulit, pengobatan pada tempat tersebut harus segera dilakukan untuk menghindari komplikasi lebih lanjut.
Penggunaan Industri / Aplikasi Pseudomonas putida
- Salah satu aplikasi penting P. putida adalah penggunaan bakteri ini dalam bioremediasi. Rute sentral metabolisme karbon di P. putida terdiri dari berbagai jalur konversi substrat berbeda yang menyediakan blok bangunan dan kofaktor yang penting bagi industri.
- Metabolisme bakteri yang serba guna memungkinkan penggunaan bakteri dalam kondisi yang tidak menguntungkan untuk degradasi senyawa yang tidak dapat terurai.
- Bakteri juga telah digunakan sebagai inokulan tanah untuk mengurangi kontaminasi naftalena dalam tanah.
- Bakteri juga dapat mengubah minyak stirena menjadi PHA plastik biodegradable yang kemudian ditindaklanjuti oleh mikroorganisme lain.
- Karena banyak strain P. putida dapat menghasilkan metabolit sekunder antibiotik yang berbeda, ini juga dapat digunakan sebagai bentuk biokontrol di bidang pertanian.
- P. putida juga telah diisolasi dari daerah rizosfer dari berbagai tanaman yang menunjukkan kemungkinan aplikasinya di bidang pertanian sebagai rhizobakteri pemacu pertumbuhan tanaman.
No comments