Pemodelan memprediksi tren penurunan kasus cacar monyet secara global dan pada skala khusus negara
Dalam penelitian terbaru yang diposting ke server medRxiv*, para peneliti di Georgia State University, AS, menghasilkan perkiraan jangka pendek kasus cacar monyet baru menggunakan model ensemble dan subepidemic
Latar belakang
Wabah monkeypox virus (MPXV) tahun ini sangat berbeda dari wabah sebelumnya karena sangat tidak pasti mengenai populasi yang terkena, penularan, dan karakteristik klinis. Misalnya, ~98% kasus di AS dan Spanyol terjadi pada pria, dengan sebagian besar diidentifikasi sebagai pria yang berhubungan seks dengan pria (LSL). Selanjutnya, kasus MPXV melonjak di banyak negara sejak Mei 2022, terutama di negara-negara non-endemik, termasuk Amerika Serikat. Tanpa preseden historis tentang bagaimana wabah ini dapat terungkap lebih lanjut, model matematika dapat membantu dengan perkiraan real-time dari lintasan epidemi MPXV.
Karena penularan MPXV terutama karena kontak dekat atau langsung dengan lesi kulit individu yang terinfeksi, dan sekresi pernapasan, langkah-langkah dasar kesehatan masyarakat dapat membantu mengendalikan penyebaran selanjutnya. Dengan demikian, peramalan jangka pendek dapat membantu mengevaluasi utilitas dan kemanjuran tindakan mitigasi, termasuk perubahan perilaku yang mengurangi tingkat penularan, pelacakan kontak, dan vaksinasi, pada tren pertumbuhan terhadap infeksi MPXV pada populasi umum.
Tentang studi
Dalam penelitian ini, para peneliti memperoleh data yang tersedia untuk umum tentang kasus MPXV mingguan yang dikonfirmasi dari Our World in Data (OWID) GitHub repository dan Centers for Disease Control and Prevention (CDC) website untuk tujuh negara dengan beban penyakit tertinggi pada saat itu. inisiasi studi dan secara global. Ketujuh negara tersebut adalah Amerika Serikat, Brasil, Inggris, Prancis, Jerman, Spanyol, dan Kanada. Mereka memperkirakan kasus MPXV baru empat minggu ke depan selama sepuluh minggu berurutan yang dinilai dengan ketidakpastian terukur dari model sub-epidemi teratas, peringkat kedua, dan ansambel dari 28 Juli 2022 hingga 13 Oktober 2022.
Untuk penilaian kecocokan dan kinerja model, para peneliti menghitung mean absolute error (MAE), mean square error (MSE), 95% prediction interval coverage (PI), dan weighted interval score (WIS). Yang terakhir mempertimbangkan ketidakpastian prakiraan, sementara MSE dan MAE menilai penyimpangan rata-rata dari model rata-rata yang sesuai dengan data yang diamati.
Temuan studi
Secara total, para peneliti melakukan 324 perkiraan mingguan berurutan empat minggu ke depan di semua negara dan model yang dipelajari. Hasil studi mengkonfirmasi tren penurunan keseluruhan dalam jumlah kasus MPXV baru secara global dan di tingkat negara. Model ensemble berperingkat teratas dan berbobot memprediksi akan ada 6232 kasus MPXV baru secara global antara 20 Oktober 2022, dan 10 November 2022. Berdasarkan data OWID, model ini memprediksi jumlah kasus MPXV baru tertinggi di AS, diikuti oleh Brasil dan Spanyol. Kedua model ini menunjukkan kinerja peramalan terbaik di semua area studi.
Kesimpulan
Seperti yang dinyatakan sebelumnya, kelompok inti orang berisiko tinggi, dalam hal ini, LSL, mendorong epidemi MPXV 2022 saat ini. Jadi ketika kekebalan yang ditimbulkan oleh infeksi atau vaksinasi berkembang dalam kelompok inti ini, kasus MPXV akan menurun secara alami. Tampaknya juga mungkin untuk mengendalikan epidemi MPXV jika kelompok berisiko tinggi ini mengadopsi langkah-langkah kesehatan masyarakat. Faktor lain yang menguntungkan adalah bahwa tidak seperti human immunodeficiency virus (HIV) and bacterial sexually transmitted diseases (STDs), MPXV tidak memiliki durasi seumur hidup atau diperoleh berulang kali. Juga, pada Agustus 2022, ketersediaan vaksin MPXV telah meningkat di AS. Ini meningkatkan proporsi penerima vaksin MPXV dari 15% menjadi 23% dan 6% menjadi 13% di antara populasi Hispanik dan Hitam, masing-masing. Selain itu, kelompok berisiko tinggi tampaknya mendorong penurunan kasus MPXV melalui modifikasi perilaku (misalnya, membatasi hubungan seksual).
Yang paling penting, akan bermanfaat untuk secara sistematis menilai kinerja peramalan model studi terhadap model sub-epidemi lainnya yang mengungguli model autoregressive integrated moving average (ARIMA) yang secara andal meramalkan 10 hingga 30 hari ke depan perkiraan penyakit coronavirus harian 2019 Kematian akibat covid19.
*Pemberitahuan Penting
medRxiv menerbitkan laporan ilmiah awal yang tidak ditinjau oleh rekan sejawat dan, oleh karena itu, tidak boleh dianggap sebagai konklusif, memandu praktik klinis/perilaku terkait kesehatan, atau diperlakukan sebagai informasi yang mapan.
Journal reference:
Real-time forecasting the trajectory of monkeypox outbreaks at the national and global levels, July – October 2022, Amanda Bleichrodt, Sushma Dahal, Kevin Maloney, Lisa Casanova, Ruiyan Luo, Gerardo Chowell, medRxiv 2022.11.02.22281844; DOI: https://doi.org/10.1101/2022.11.02.22281844, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.11.02.22281844v1
No comments